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SeqWright, ein weltweit führendes Unternehmen für Auftragsarbeiten in den Bereichen Genetik und Molekularbiologie, hat eine Zusammenarbeit mit Roche Applied Science und der Miller School of Medicine der Universität Miami bekanntgegeben, bei der Next-Generation-Sequenzierung und die neuesten Entwicklungen der Sequence-Capture-Technologie eingesetzt werden. Bei dieser Forschungsarbeit geht es um eine große Studie zur Identifizierung von Genvarianten, die möglicherweise mit dilatativer Kardiomyopathie, einer Herzmuskelerkrankung, in Zusammenhang stehen. MYAUTO.TO | FORUM | Alles rund ums Auto. Im Rahmen dieser Kooperation verwendete SeqWright die Sequence-Capture-Human-Exome-Arrays von Roche NimbleGen, um aus DNA-Proben von Personen mit dilatativer Kardiomyopathie über 180. 000 Exons anzureichern. Mit Hilfe des Genome Sequencer FLX von 454 Life Sciences sequenziert SeqWright nun die angereicherten Exons mit dem Ziel, genetische Varianten wie Single-Nucleotide-Polymorphismen (SNPs), Insertionen und Deletionen zu identifizieren. Die Gesamtlösung von Roche erlaubt die gezielte Resequenzierung aller kodierenden Exons, also des "Exom" genannten Teils des menschlichen Genoms.
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"Den gesamten kodierenden Anteil des menschlichen Genoms zu sequenzieren war bis vor kurzem noch nicht möglich. Erst neue Entwicklungen von Genomik-Werkzeugen der nächsten Generation ermöglichen Forschern die effiziente Charakterisierung des gesamten Exoms und führen zu sehr viel schnelleren Forschungsergebnissen, " sagte Dr. Fei Lu (MD), Geschäftsführer von SeqWright. Xentry diagnostics grundlagen und funktionen in ny. "Es ist faszinierend, wie schnell diese Werkzeuge die Forschung verändert haben. Ich bin stolz darauf, dass SeqWright an vorderster Front der Forschergemeinde diese Technologien nahezu ebenso schnell, wie sie entwickelt werden, auch einsetzt. " "Dilatative Kardiomyopathie ist eine der Hauptursachen von Herzversagen, mit einer hohen Mortalität, " sagte Dr. Nadine Norton (PhD), Research Assistant Professor an der Miller School of Medicine der Universität Miami. "Wir wissen, dass die familiäre dilatative Kardiomyopathie (FDC) durch Mutationen von mehr als 20 autosomalen und zwei auf dem X-Chromosom liegenden Genen ausgelöst werden kann, aber nur ein Drittel der Fälle werden von einer dieser Mutationen ausgelöst.
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Diese bieten einen höheren Informationsgehalt und eine bessere Datenqualität, wie sie für die Erforschung der gesamten genomischen und epigenomischen Variabilität erforderlich sind. Die verbesserte Leistung ist der Maskless-Array-Synthesis-Technologie (MAS) von Roche NimbleGen zu verdanken. Diese synthetisiert äußerst flexibel mittels Mikrospiegeltechnik und schneller, hocheffizienter Photochemie lange Oligonukleotide für die hochdichten DNA-Microarrays. Weitere Informationen über Roche NimbleGen finden Sie auf der Website des Unternehmens, unter. 454 Life Sciences, ein Center of Excellence von Roche Applied Science, entwickelt und vermarktet das innovative 454-Sequenziersystem für die ultraschnelle Hochdurchsatz-DNA-Sequenzierung. Kooperation von Roche und SeqWright soll bei der Aufklärung der genetischen Grundlagen einer Herzerkrankung helfen, Roche Diagnostics Deutschland GmbH, Pressemitteilung - PresseBox. Spezifische Anwendungsfelder der Technik sind zum Beispiel die De-novo-Sequenzierung und Resequenzierung von Genomen, Metagenomik, RNA-Analyse und die gezielte Sequenzierung bestimmter DNA-Bereiche. Das 454-Sequenziersystem zeichnet sich durch eine einfache, unvoreingenommene Probenvorbereitung und lange, präzise Leseweiten, auch bei Paired-End-Sequenzierung, aus.